Umbes 19. sajandi lõpust hakkasid teadlased koguma teadmisi pro- ja eukarüootsete rakkude erinevuste kohta ning eraldasid nii järk-järgult eraldi mikroorganismide kuningriigi, mida ühendas rakkude diferentseerumise puudumine – Protista. Mis on aga bakterid, tuli neil tol ajal vaid uurida: alles 20. sajandil. need teadmised on süstematiseeritud.
Bakterid asuvad kõigis keskkondades, kuhu võib koguneda orgaaniline aine. Nad taluvad kõrget ja madalat temperatuuri, soolsust ja happesust. Seega ei ela bakterite kuningriik mitte ainult keskkonnas, kus nad lagundavad oma elutegevuseks orgaanilist ainet, vaid asustavad tihed alt paljusid loomade ja inimeste limaskestasid, aidates toitu seedida ja konkureerida patogeensete mikroorganismidega. Nende roll lämmastiku metabolismis on eriti suur, kuna ainult tsüanobakterid on võimelised töötlema õhulämmastikku. Mõned bakterid on aga haiguste tekitajad: katk, anaeroobsed ja sooleinfektsioonid, süüfilis, koolera ja siberi katk.
Morfoloogia
Bakterite ultrastruktuuri saab näha ainult elektronmikroskoobiga, kuid millised bakterid endast kujutavad ja kuidas nad väljastpoolt välja näevad, saab näha ka sukelmikroskoopia abil, kasutades spetsiaalseid värvimistehnikaid. Nende mikroorganismide suurused varieeruvad vahemikus 0,1 kuni 10 mikronit, kuid bakterite morfoloogia võimaldab neid jagada 3 põhirühma: sfäärilised - kokid (mono-, diplo-, tetra-, streptokokid ja sarkiinid), pulgakujulised - batsillid (mono-, diplo-, strepto-) ja keerdunud - vibrioonid, spirillad ja spiroheedid. Laboratoorsetes tingimustes kasvatatakse neid tüübi ja ensümaatiliste omaduste määramiseks lihtsal või spetsiaalsel toitesöötmel, moodustades kolooniaid, ning erinevates söötmetes on neil erinev kasvumuster.
Ehitis
Üldiselt määrab, millised bakterid on, nende ultrastruktuur. Väljaspool kaitseb baktereid rakusein, mis koosneb peptidoglükaani, lipiidide ja teikhoehapete kihtidest. Esimeste kontsentratsioon määrab bakterite värvimisvõime Grami meetodil äigepreparaadis, mille järgi nad liigitatakse Gr + ja Gr-. Mõnel neist on täiendav kaitsestruktuur - kapsel, mis sisaldab K-antigeeni ja takistab nende fagotsütoosi makroorganismis, toksiliste ja mehaaniliste tegurite mõju. Bakterite kohta lisateabe saamiseks peate uurima nende rakusisest struktuuri: bakterid on täidetud tsütoplasmaga, milles on lahustunud teised organellid (ribosoomid, kromatofoorid) ja toitainete lisandid (lipiidid, suhkrud). Nad on naguja kõigil prokarüootidel puudub formaliseeritud tuum ning kogu geneetiline informatsioon on talletatud kaheahelalises nukleiinhappemolekulis, mis asub nukleoidi tsoonis ja on ühes punktis membraani külge kinnitatud. Väljaspool seda sisaldub geneetiline teave plasmiidides, mis võivad määrata patogeensete omaduste ja tegurite arengut. Liikumiseks kasutavad nad flagellat ja spirillat, mis on rakus fikseeritud basaalkehaga, ning nende paljundamine toimub kaheks jagamisel.